Powstanie muzeum było możliwe dzięki ofiarności bosmana Erwina Pasternego. Urodził się w Jaworzu Średnim w 1928 r. i tu zdobył wykształcenie podstawowe. Realizując swoje młodzieńcze marzenia, kontynuował naukę w szkołach morskich, zdobywając stopień bosmana. Pływał po całym świecie, zgłębiając jednocześnie tajniki życia oceanów. Zaczął też łowić, a następnie preparować różne stworzenia morskie. Część swojej kolekcji okazów przyrody mórz południowych podarował szkole w Jaworzu.
Muzeum Fauny i Flory Morskiej rozpoczęło swoją działalność w 1969 r. Najciekawszymi eksponatami są m.in. żółw morski, rekiny (w tym rekin młot), ośmiornice, mięczaki, jeżowce.
Muzeum Fauny i Flory Morskiej zostało uroczyście otwarte 5 września 2014 roku.
Wizyta w Muzeum trwa ok. 1,40 godziny; grupy zorganizowane oraz indywidualni zwiedzający rezerwują bilety poprzez system rezerwacji na stronie http://www.muzeum.jaworze.pl
Obok Muzeum Flory i Fauny znajduje się Motylarnia, która jest również dostępna do zwiedzania.