Dawna zbrojownia , pierwszy arsenał został zbudowany pod koniec XVI wieku po północnej stronie pałacu Zamoyskich. Jan Zamoyski gromadził w nim swoje zdobycze i trofea z licznych wypraw, dla ich upamiętnienia. Nowy arsenał wybudowano jednak w I poł. XVII wieku na południe od pałacu, w pobliżu dawnego bastionu III (dzisiejsza ul. Zamkowa, południowo zachodni fragment Starego Miasta). Uległ on jednak częściowemu zniszczeniu podczas pożaru w roku 1658, po którym w latach 70. tego stulecia pojawił się obecny budynek, o długości ponad 60 m. Początkowo posiadał jedną kondygnację, drugą dobudowano w I poł. XIX wieku podczas modernizacji zamojskiej twierdzy. Wówczas, jak wiele innych budynków na Starym Mieście, przebudowany został w stylu klasycystycznym, pojawiły się również obecne arkady (arkadowy portal) i schody na pierwsze piętro, przy wejściu do tego budynku. W tym czasie stanowił także areszt oraz magazyny i stajnie wojskowe. W okresie międzywojennym mieściły się tu szkoły, po II wojnie światowej warsztaty (stolarnia), a od roku 1984 Muzeum Barwy i Oręża "Arsenał" (jako oddział Muzeum Zamojskiego).
Multimedialna opowieść o twierdzy po raz pierwszy można było obejrzeć 8 listopada 2014 r. Okazją do udostepnienia zwiedzającym prochowni i wyremontowanego Arsenału było oficjalne podsumowanie postępu prac, wykonanych na Starówce w ramach dwóch unijnych projektów: „Zamość, miasto UNESCO, pomnik historii RP, produktem turystycznym polskiej gospodarki”, oraz „Muzeum Broni i Fortyfikacji w obrębie Bastionu III i Arsenału”. Salę audiowizualna Arsenału, wyposażono w duży , trójwymiarowy stół projekcyjny z holograficzną makietą. Prezentuje ona poszczególne etapy budowy twierdzy, kierunki jej modernizacji i przedstawia konkretne wydarzenia, jak pożary czy ataki na mury. Prezentacja została wzbogacona o ścieżkę dźwiękową, która pomaga widzowi przenieść się w odległą historię. Słychać stukot końskich kopyt, gwar jarmarczny, odgłosy walk i wystrzały z dział. Seans trwa ok. 20 min. natomiast sala projekcyjna może pomieścić 40 turystów. Dotychczasową ekspozycję wzbogacono o repliki uzbrojenia m.in. armaty przeciwpancernej Bofors. W salach pojawiły się manekiny w umundurowaniu żołnierzy Legionów Polskich, oficera i szeregowego Armii Austro – Węgierskiej, oficera Armii Hallera, szeregowego 2 pułku strzelców konnych. Budynek wyposażono w książkę elektroniczną, z zeskanowanym traktatem o artylerii i fortyfikacj. Książka ma dotykowe menu- kartki przewracamy, przesuwając ręką po ekranie .Autorem traktatu jest znana z historii Zamościa, postać Andrea dell Aqua. Pochodził z Wenecji. Służył u Tomasza Zamoyskiego- zarządzał Arsenałem, szkolił puszkarzy, modernizował fortyfikacje. Na piętrze Arsenału udostępniono wystawę czasowa „Homo Faber”- narzędzia, które służyły człowiekowi od zarania dziejów do współczesności.
Kesz - magnetyk w 3 ławce , pod kordami.